Администрация Панамского канала вызвала беспокойство среди работников и населения в целом из-за ее управления. Особое внимание уделяется использованию опасных буксиров, которые привели к нескольким серьезным происшествиям, создавая неуверенность. Критикуется ограничение права на забастовку работников канала.
Администрация также критикуется за произвольное применение дисциплинарных мер, с излишне одобрительной Комиссией по трудовым отношениям в сторону руководства канала. Работники выигрывали трудовые споры, решения по которым администрация отказалась выполнять, даже пренебрегая решениями Верховного Суда.
Поставляется под сомнение прозрачность деятельности администрации, указывая на игнорирование прав работников и наблюдается недостаточное внимание к окружающей среде, как в последнем случае разлива топлива в водах канала. Требуется аудит и расследование действий сотрудников организации.
Недостаток планирования и административного управления привели к экономическим потерям и ограничениям в работе канала, связанным с атмосферными явлениями. Судейские комиссии критикуются за их предвзятость, в то время как наблюдается несоответствующее обслуживание оборудования, что привело к его преждевременному износу.
Федерация Профессиональных Ассоциаций Панамы выразила беспокойство по поводу управления администрацией канала, указывая на увеличение операционных происшествий и подчеркивая важность отчетности перед истинными владельцами этого национального актива. Мигель Антонио Бернал Вильялаз, президент ФЕДАП, призвал к пересмотру практик администрации в интересах национальных интересов.
