Экологи выразили свою обеспокоенность по поводу экологических последствий строительства участка 2 Шоссе Карибского коридора, где зарегистрированы значительные потери лесного покрова. Дорога проходит через зону с высоким биоразнообразием, включая Биологический Коридор Мезоамерики, бассейн канала и зоны охраны национальных парков.
Рафаэль Самудио, директор Центра исследования и подготовки в области сохранения биоразнообразия Панамского Зоологического Общества (Somaspa), критиковал методы сбора информации о позвоночных видов в Оценке Воздействия на Окружающую Среду (ОВОС) категории III. Он отметил, что сроки отбора образцов были недостаточными, и не было учтено ночное время, что поставило под угрозу уязвимые и находящиеся на грани исчезновения виды.
Экологическая юристка Сусана Серасин также подвергла сомнению ОВОС участка 1 проекта, указав на недостаточную точность в отношении воздействия на старые леса, отсутствие информации о уязвимости зоны и отсутствие упоминаний о Биологическом Коридоре Мезоамерики. Работы выполнены на 24,5%, приостановка участка 2 временно из-за приказа Верховного Суда.
Somaspa заключил, что проекту не хватило должного экологического сопровождения, а рабочие выразили беспокойство из-за остановки участка 2 и потери работы. Заявление об аннулировании общественных слушаний по ОВОС категории III проекта участка 1 было представлено Акционерным частным консорциумом, указывая на нарушение норм о гражданском участии.
Проект Шоссе Карибского коридора, разделенный на два участка, был подвергнут критике из-за игнорирования кумулятивных воздействий в зоне. Строительство, которое осуществляется Консорциумом Трансек-Эстерла по заказу Министерства Общественных Работ, вызвало вопросы из-за предполагаемого фрагментирования проекта и неудовлетворительного проведения общественных слушаний, на которых был представлен ОВОС участка 1.
